Thực hiện theo Quyết định số 1866/QĐ-KTNN ngày 28/11/2019 của Kiểm toán Nhà nước về việc ban hành Kế hoạch kiểm toán năm 2020 đối với các tỉnh thành trong cả nước với nhiều chuyên mục kiểm toán như: Kiểm toán ngân sách Nhà nước; kiểm toán hoạt động; kiểm toán chuyên đề; kiểm toán hoạt động và xây dựng, quản lý sử dụng vốn đầu tư; kiểm toán báo cáo tài chính; kiểm toán lĩnh vực quốc phòng...
Dự án Đường cất hạ cánh số 02- Cảng Hàng không Quốc tế Cam Ranh được phê duyệt đầu tư xây dựng mới với thời gian thực hiện 2015-2020 thuộc nguồn vốn ngân sách tỉnh và trung ương. Năm 2020, theo kế hoạch kiểm toán các hoạt động xây dựng, quản lý, sử dụng vốn đầu tư của Kiểm toán Nhà nước thì dự án Đường Cất hạ cánh số 02- Cảng Hàng không Quốc tế Cam Ranh do Ban QLDA đầu tư xây dựng các công trình Giao thông Khánh Hoà làm Chủ đầu tư sẽ được thực hiện kiểm toán theo quy định.